Фамилия Крганова — редкий случай, когда написание говорит о происхождении больше, чем звучание. Отсутствие гласной между первыми двумя согласными («Крг-») сразу выдает нерусскую основу. В исконно русских фамилиях такое стечение согласных на стыке корня и суффикса почти не встречается. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского или кавказского корня, русифицированная с помощью типичного русского суффикса -ов- (в женском роде — -ова). Основа «Крган» — это, вероятно, искаженное при переносе в русский язык тюркское имя или прозвище.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с тюркским словом «курган» — насыпь, древняя могила, а в переносном смысле — «крепость», «богатырь». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «курган» или «корган» может входить в состав личных имен. Переход «курган» → «крган» в русской записи — обычное дело: безударная гласная «у» редуцировалась и при оформлении фамилии в документах могла просто выпасть. Так же появились фамилии Крганов, Крганян (у армян) и даже польские варианты. Менее вероятна связь с армянским «крганк» (ծուխ — «дым», «очаг»), но и это не исключено: фамилия могла возникнуть в среде армян, переселившихся в тюркскую или русскую среду.

По суффиксу «-ов» можно предположить, что фамилия сложилась в среде, где русская администрация или церковь фиксировала фамилии по отчеству: «чей?» — «Крганов сын». Значит, предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином, мещанином или казаком, получившим фамилию по имени отца или прозвищу. Сословная принадлежность невысокая — дворянские фамилии с такой основой почти не встречаются.

Географически фамилия Крганова встречается в регионах с сильным тюркским и кавказским влиянием: в Поволжье (Татарстан, Башкортостан), на Северном Кавказе, а также в среде армянской диаспоры. Встречаемость низкая — это не массовая фамилия, а скорее локальная, что подтверждает её происхождение от конкретного прозвища или имени, а не от названия профессии или места.

Таким образом, Крганова — это фамилия, которая прошла путь от тюркского или армянского прозвища (возможно, «сын кургана» или «очажный») до русского документального оформления. Главная особенность — её написание сохранило следы устной речи, где гласная «у» «проглотилась», и эта черта делает фамилию уникальным маркером языкового контакта.