Фамилия Крипухин образована от прозвища Крипуха, которое, в свою очередь, восходит к глаголу «крипеть» — так в русских говорах (особенно южных и западных) называли скрипеть, издавать резкий, неприятный звук. Слово «крип» или «крипа» могло относиться к человеку с хриплым, сиплым голосом, либо к тому, кто постоянно ворчал, «скрипел» по пустякам. В некоторых диалектах «крипухой» называли также старую, рассохшуюся утварь или скрипучую дверь — метафора могла быть ироничной и относиться к медлительному, «заржавевшему» человеку.

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «сын Крипухи». Это патронимическая фамилия, распространённая в среде крестьян и мещан. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от основ на твёрдый согласный, суффикс -ин характерен для основ на -а, -я. Таким образом, Крипухин — буквально «чей?» — «Крипухин», то есть потомок человека по прозвищу Крипуха.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским регионам, а также к бывшим территориям Слобожанщины (современная Украина и приграничные области России). Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении прозвища. В документах XVII–XVIII веков можно найти однокоренные фамилии — Крипунов, Крипаков, Крипский, но Крипухин стоит особняком благодаря редкому суффиксу -ух-, который вносит оттенок пренебрежительности или просторечности. Это позволяет предположить, что прозвище дали не за уважаемое ремесло, а за бытовую, скорее всего, не самую лестную черту — скрипучий голос или въедливый характер.

В словаре Б. О. Унбегауна «Русские фамилии» модель с суффиксом -ух(а) описывается как типичная для образования прозвищ от глаголов звукоподражательного характера. Крипухин вписывается в этот ряд наравне с Визгухиным, Свистухиным или Брюзгиным. Есть и альтернативная версия, связывающая основу с тюркским «крип» — «скрытый, тайный», но она маловероятна: фонетика и семантика русского глагола «крипеть» перекрывает её с большей убедительностью, к тому же фамилия не встречается в зонах интенсивного тюркского влияния.

Если ваш предок носил фамилию Крипухин, он почти наверняка происходил из крестьянской или мещанской среды юга России, а его прозвище закрепилось за ним из-за особенности голоса или поведения — скрипучего, въедливого, заметного окружающим.