Фамилия Крипушина — женская форма, а её мужской вариант Крипушин. В основе фамилии почти наверняка лежит прозвище Крипуша. Оно образовано от глагола «крипеть» — старого диалектного слова, означавшего «скрипеть», «издавать скрипучий звук». В говорах «крипуша» или «крипа» могли называть человека со скрипучим голосом, либо того, кто при ходьбе скрипит обувью или костями — например, пожилого или больного. Реже прозвище давали мастеровому, работа которого сопровождалась скрипом: тележнику, столяру, плотнику.

Модель образования проста: суффикс -уша характерен для русских прозвищ, описывающих внешность или поведение (ср. Толстуша, Ворчуша, Скрипуша). От Крипуши через патронимический суффикс -ин (чей? — сын Крипуши) и возник Крипушин. Фамилия недворянская, скорее крестьянская или посадская, типичная для центральных и северных губерний России, где диалектное слово «крипеть» было особенно употребительно.

В написании фамилии возможна путаница с однокоренной Крипунов (от «крипун» — скрипун). Но суффикс -уша даёт более ласкательный или бытовой оттенок: Крипуша — не просто скрипучий, а «скрипучий малый», «скрипучий дружок». В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне Крипушины в Вятской и Пермской губерниях — это косвенно подтверждает севернорусское происхождение.

Фамилия редкая, не имеет отношения к украинским или белорусским корням: там аналогичные формы строились бы через суффиксы -енко или -ук. Крипушина — чисто русская фамилия, сохранившая в основе живое звучание диалектного слова, почти исчезнувшего из современного языка.