Фамилия Крокозябрин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, живёт собственной жизнью в языке, а его значение угадывается интуитивно. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Крокозябрин — это «сын Крокозябры» или «человек из семьи Крокозябры». Но что такое «крокозябра»?

Самая правдоподобная версия: в народной речи «крокозябра» — шуточное или бранное название нелепого, странного существа, нечто вроде «крокодила» и «зебры» в одном флаконе. Прозвище Крокозябра могли дать человеку с необычной внешностью, несуразной походкой или вздорным характером. Такие прозвища — «чудо-юдо», «ерунда», «бука» — были типичны для деревенской среды, где меткое слово закреплялось за человеком на всю жизнь. Фамилия образована по той же модели, что и Букарин, Ерундов или Чудин.

Менее вероятна гипотеза о заимствовании из другого языка. В польском или украинском встречается слово «krokozybr» как искажённое «krokodyl», но это скорее местный говор, а не отдельное имя. Спор о том, было ли прозвище обидным или шутливым, решается просто: в ономастике такие основы редко несли злой умысел, чаще — подчёркивали яркую черту.

Географически фамилия Крокозябрин почти не встречается в официальных ревизских сказках XIX века. Это говорит о позднем оформлении — возможно, в советское время, когда паспортизация закрепила за потомками прозвище, которое до того бытовало только в устной речи одной семьи. Если искать аналоги, то ближе всего фамилии вроде Крокодилов, Зебрин или Чудаков — все они образованы от прозвищ, описывающих внешность или поведение.

Единственная деталь, которая выделяет Крокозябрина среди однокоренных, — это полное отсутствие у основы серьёзного, «благородного» значения. Фамилия осталась чистым свидетельством народного юмора: предок был настолько необычен, что его сравнили с вымышленным зверем, и это прозвище пережило века.