Фамилия Крпухин — редкий случай, когда написание подсказывает разгадку. Сразу бросается в глаза необычное скопление согласных «кр-п» в начале. Скорее всего, перед нами не исконная форма, а упрощение, возникшее из-за неудобства произношения или ошибки писаря. Исходной основой могло быть слово «корпух» или «карпух» — диалектное название коршуна или ястреба. В некоторых говорах «корпух» означало крупную хищную птицу, а в переносном смысле — жадного, хваткого человека. Тогда фамилия образована по типичной модели с суффиксом -ин: Крпухин — сын Крпуха, то есть человека с прозвищем Корпух.

Есть и вторая версия, не менее правдоподобная. На юге России и в Белоруссии фамилию могли записать от прозвища «Корпуха» — так называли человека крепкого телосложения, коренастого, от слова «корпус» (тело, стан). В этом случае фамилия перешла в разряд характеризующих: Крпухин — потомок плотного, сильного мужчины. Утрата гласной «о» в первом слоге типична для живой речи, когда имя или прозвище произносили быстро: «Корпухин» — «Крпухин».

Суффикс -ин указывает на принадлежность к роду: «чей?» — Крпухин. Такая модель преобладала в северных и центральных русских землях, а также в среде крестьянства и мещанства. Сословных ограничений у этой фамилии не было — её мог носить и крестьянин, и посадский человек. В дореволюционных источниках фамилия почти не встречается, что подтверждает её локальный характер и возможное происхождение от устного прозвища, а не от церковного имени.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Крпухин стоит в одном ряду с Корпуховым, Корпухиным, Карпухиным. Последняя форма особенно показательна: Карпухин — вариант от имени Карп, но через народную переделку «Карпуха». Если бы основа была от имени, мы бы ждали форму «Карпухин», а не «Крпухин». Значит, связь с птицей или телосложением надёжнее.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям — Курской, Воронежской, Ростовской, а также к восточной Украине. В этих краях слово «корпух» в значении «коршун» было в ходу, и прозвища по птицам давали часто: за внешнее сходство, за характер или за профессию — например, охотнику с ловчей птицей.

Таким образом, Крпухин — фамилия-загадка, где потерянная гласная скрывает две возможные истории. Но обе они ведут к прозвищу, которое дали предку: либо за хищную цепкость, либо за крепкую стать.