Фамилия Кряченков — один из тех случаев, когда в основе лежит не имя, а яркое прозвище. Её ядро — глагол «крякать», который в русских говорах имел не только звукоподражательное значение (как утка), но и переносное: «крякать» могли о человеке, который издавал хриплый, надрывный звук, кряхтел от натуги или имел сиплый голос. В некоторых диалектах «кряк» — это и вовсе сиплый, хриплый голос. Таким образом, первый носитель прозвища Кряк или Кряченко, скорее всего, выделялся манерой говорить или характерным покашливанием.

Суффикс -енк- в основе (Кряченко) указывает на украинское или южнорусское происхождение: на Украине и в прилегающих областях России так образовывали фамилии от прозвищ (сравните: Коваль — Коваленко, Бондарь — Бондаренко). А вот конечный суффикс -ов — это уже обрусевшая форма, типичная для тех, кто перебрался в великорусские губернии или чью фамилию записывали по московскому образцу. Получается, что Кряченков — это «русифицированный» вариант фамилии Кряченко, который закрепился в документах.

Версия с именем Крячко (уменьшительное от Кирилл или Кронид) менее вероятна, хотя и встречается в ономастике. Но для фамилии Кряченков прозвищная основа выглядит убедительнее: слишком конкретна и жива звуковая ассоциация. В словаре древнерусских прозвищ Веселовского встречаются «Кряк» и «Крякун» — люди с таким прозвищем были известны в XV–XVI веках, что подтверждает древность корня.

Географически фамилия Кряченков тяготеет к регионам, где пересекались украинское и южнорусское влияние: Курская, Белгородская, Воронежская области, а также Ростовская и Краснодарский край. Встречается она нечасто, что делает её характерной для конкретных родовых гнёзд. Предки носителей этой фамилии, вероятно, были крестьянами или казаками — прозвища в этой среде давали меткие и ёмкие, по внешнему признаку или поведению.