Фамилия Крычун — редкий пример, когда прозвище закрепилось в чистом виде, без типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский. В основе лежит мирское имя или прозвище Крычун, напрямую связанное с глаголом «кричать». Такая модель образования (глагольная основа + суффикс -ун) характерна для прозвищ, которые давали по яркой поведенческой черте: говорун, молчун, ворчун. Крычун — тот, кто постоянно кричит.

Чаще всего так называли беспокойного, крикливого или капризного ребенка. Но прозвище могло закрепиться и за взрослым человеком. Тут возможны два варианта: либо обладатель необычайно громкого голоса (такое качество ценилось, например, у глашатаев или мастеров, работавших на шумном производстве), либо, наоборот, человек вспыльчивый, раздражительный, привыкший решать дела на повышенных тонах.

Южнославянский суффикс -ун (сравните сербские фамилии Дргун, Вигун) в русских фамилиях встречается нечасто. Это может указывать на западно- или южнорусское происхождение рода, либо на влияние украинской или белорусской традиции именования, где такие формы более распространены. В отличие от фамилий на -крикун, вариант Крычун сохранил древнюю огласовку корня (чередование «и»/«ы»), что делает его особенно интересным для этимолога.