Фамилия Ксимов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Первое, что бросается в глаза, — основа «Ксим-». Она не типична для славянских имён или прозвищ, поэтому сразу отпадает версия о прямом русском корне. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от неканонического имени или прозвища, которое, в свою очередь, могло быть заимствованным или искусственно переосмысленным.

Наиболее вероятное объяснение — связь с греческим именем Ксенофонт (Ξενοφῶν) или его сокращённой формой. В русской традиции полное имя Ксенофонт давали при крещении, но в быту использовали краткие варианты: Ксен, Ксеня, Ксим. От этого «Ксим» и возникла фамилия с помощью стандартного патронимического суффикса -ов, означающего «сын Ксима». Подобное усечение — обычное дело для русских фамилий: от Димитрий — Димов, от Агафон — Агафонов. В пользу этой версии говорит и то, что имя Ксенофонт было распространено в среде духовенства и купечества, где любили греческие имена.

Вторая, менее распространённая гипотеза, выводит фамилию из тюркских языков. В ряде тюркских диалектов есть корень «ксым» или «ксын», означающий «скупой», «жадный». В этом случае Ксимов — потомок человека, получившего прозвище Ксим за свой характер. Однако географическая привязка здесь слабее: фамилия встречается в центральных регионах России, а не в Поволжье или на Урале, где тюркское влияние сильнее.

Если отталкиваться от суффикса -ов, то модель образования типична для великорусских фамилий, сформировавшихся в XVI–XVII веках. Это значит, что предок носителя фамилии жил в центральной или северной части России и, скорее всего, был крестьянином или посадским человеком. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её «низовое» происхождение.

С точки зрения словообразования важно заметить: фамилия не имеет суффиксов -ин, -ский или -их, которые указывали бы на другую региональную или сословную привязку. Ксимов — чистая отчество, что делает её историю прозрачной: был человек по имени или прозвищу Ксим, и его дети стали Ксимовыми. Сегодня фамилия остаётся редкой, и её носители, скорее всего, потомки одного или нескольких родов, разошедшихся по разным губерниям.