Фамилия Ксюпов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Ксюпов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Ксюпов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Ксюпов образована от имени Ксюп. Вероятно, в его основе лежит арабское слово «кусуф» - «затмение» или «хусуф» - «лунное затмение». Следовательно, имя Ксюп мог получить ребенок, родившийся во время затмения. Под влиянием татарского или башкирского языка произошло чередование гласных у/ю, согласных х/к и ф/п. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Ксюпов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Ксюпов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.