Фамилия Каюпов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Каюпов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Каюпов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Каюпов восходит к мусульманскому мужскому имени Каюп, которое в переводе с арабского означает «вечно живой; не меняющийся, твердый, надежный», это одно из имен Аллаха. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Каюпов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Каюпов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.