Фамилия Ксюпова — редкий случай, когда в основе лежит не имя или профессия, а, скорее всего, прозвище, образованное от глагола. Разберём её по косточкам.

Корень «ксюп-» явно восходит к русскому диалектному глаголу «ксюпать» или «ксюпить». В некоторых говорах это слово означало «хныкать», «плакать», «ныть» или «капризничать». Человека, который часто жаловался, был плаксивым или вечно недовольным, в народе могли прозвать Ксюпа. Прозвища по поведению — один из древнейших пластов русской антропонимии, и в крестьянской среде они давались очень метко.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — «Ксюпов». Первоначально это было отчество: сын Ксюпы. Со временем, когда фамилии стали закрепляться за целыми родами, форма «Ксюпов» перешла в разряд фамильных. Женская форма Ксюпова, соответственно, означает «жена или дочь Ксюпова».

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и, возможно, украинским говорам. Глагол «ксюпать» встречается в курских, орловских и воронежских диалектах, что даёт основание предполагать, что предки носителей фамилии происходят из этих мест. Встречаются также варианты написания через «и» — Ксипов, но исходная форма с «ю» более архаична и точнее передаёт звучание диалектного слова.

Сословно фамилия, скорее всего, крестьянская или однодворческая. Бояр или дворян с таким прозвищем история не знает — слишком уж бытовой и нелестный оттенок у основы. Но в этом и ценность: фамилия Ксюпова — живое свидетельство того, как в русской деревне могли «окрестить» человека за характер, и это прозвище пережило века.