Прозвище Кубышка образовано от слова «кубан» — большая крынка, кувшин с носиком и ручкой. Кубышкой же называли высокую кадку для кумыса и для битья масла. Поэтому можно предположить, что основатель рода Кубышкиных занимался изготовлением посуды. Однако не исключено, что прозвище Кубышка носил плотный коротыш, толстячок, поскольку кубышкой также называли узкогорлую посудину с раздутыми боками. Веселовского записаны: Кубышка Василий, крестьянин, 1593 г., Арзамас; Кубышкин Иван, крестьянин, 1634 г., Нижний Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Кубышка, со временем получил фамилию Кубышкина.