Фамилия Кудуштеев — редкий случай, когда в основе лежит не русское, а тюркское слово, причём с неочевидным значением. Разберём её по частям.

Корень фамилии — «кудуш» или «кудуш-». Вероятнее всего, он восходит к тюркскому «кудус» (в некоторых диалектах — «кудыш»), что значит «святой», «священный». В башкирском, татарском и казахском языках есть слово «күдүс» (святость), а в чувашском — «кӗтуш» (священный, чистый). Таким образом, прозвище Кудуш могло означать «святой человек», «благочестивый» или даже относиться к человеку, связанному с религиозным культом. Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским «кудык» (колодец, источник), но тогда фамилия скорее звучала бы как Кудуков.

Суффикс «-еев» — это адаптированный к русской грамматике тюркский аффикс принадлежности. В оригинале фамилия могла выглядеть как Кудуш-ев или Кудуш-улы (сын Кудуша). Русская модель «-ев» (реже «-ов») закрепилась при переходе в православную среду или при записи в метрические книги. Двойная «е» в суффиксе («-еев») — результат стяжения: основа на мягкий согласный («Кудуш» + «ев» дало «Кудушев», а вариант «Кудуштеев» мог возникнуть из-за диалектного произношения или ошибочной записи, где «ш» перешло в «шт»).

Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Приуралья — территориям, где исторически жили татары, башкиры, чуваши и другие тюркские народы, переходившие в православие или вступавшие в контакты с русским населением. Кудуштеевы могли быть выходцами из крещёных татар (кряшенов) или из служилых людей, получивших фамилию при записи в казачьи или солдатские списки.

Интересная деталь: в русских фамилиях на «-еев» часто скрывается старое тюркское имя или прозвище, которое уже не употребляется. Кудуштеев — не исключение. Если ваши предки носили эту фамилию, они, скорее всего, происходили из среды, где смешались тюркские и славянские традиции, а само прозвище Кудуш указывало на уважение или религиозный статус человека. Никакой другой, более популярной версии происхождения у этой фамилии нет — она однозначно тюркская по корню и русская по оформлению.