Фамилия Кукеева — характерный пример того, как тюркское имя легло в основу русского родового прозвания. Её ядро — мужское имя Кукей, которое, скорее всего, образовано от древнетюркского «кӧк» (синий, небесный) с уменьшительно-ласкательным аффиксом -ей. Получается что-то вроде «Синенький» или «Небесный» — ласковое внутрисемейное прозвище.

Есть и вторая версия, не менее убедительная. Имя Куке (или Кукей) могло восходить к монгольскому «хохээ» — кукушка. У тюркских и монгольских народов такое имя нередко давали единственному ребёнку в семье: кукушка в фольклоре — символ одиночества и тоски, и имя должно было уберечь мальчика от смерти или подчеркнуть его особое положение. Этот вариант объясняет и редкий суффикс -ей: он мог быть адаптацией тюркского аффикса при заимствовании в русскую речь.

Обратите внимание на суффикс самой фамилии. Окончание -ева указывает на принадлежность: Кукеева — дочь или жена Кукея. В русской традиции фамилии на -ев/-ов сначала закреплялись как отчества, а затем переходили в родовые имена. Значит, первого носителя фамилии в документах записали как «Иван Кукеев сын», то есть сын человека по имени Кукей.

Точное место возникновения рода Кукеевых назвать сложно. Фамилия встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири — там, где исторически были сильны тюркские влияния и активно шёл процесс русификации нерусских имён. Окончательно прояснить историю конкретной ветви могут только генеалогические изыскания с опорой на метрические книги и ревизские сказки.