Основой фамилии Кукушкин послужило мирское имя Кукушка. Фамилия Кукушкин восходит к мирскому имени Кукушка. Вероятно, родители, нарекая своего ребёнка таким именем, рассчитывали на то, что кукушка станет покровительствовать их ребёнку в будущем и передаст ему часть своих качеств. Слово «кукушка» используется как ласковое обращение к женщине. Однако не следует исключать возможность того, что в основу фамилии Кукушкин легло прозвище Кукушка, данное вдове или нерадивой матери, покинувшей своих детей. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Кукушка, со временем получил фамилию Кукушкин. Фамилия Кукушкин входит в группу так называемых «птичьих» фамилий и восходит к нарицательному «кукушка», которое легло в основу прозвища Кукушка. Однако «кукушка» - это не только птица, так называли на Руси беззаботную мать, покидающую своих детей. Прозвище Кукушка мог носить человек, который постоянно говорил что-то неуместное. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Кукушка, со временем получил фамилию Кукушкин.