Фамилия Кушьян — редкий случай, когда географический и языковой следы почти наверняка ведут в одно место, но точное исходное слово восстановить непросто. В русском языке фамилия на -ян однозначно указывает на армянское происхождение: это патронимический суффикс, означающий «принадлежащий к роду такого-то» или просто «сын такого-то». В самой Армении фамилии на -ян носят большинство, но для русского уха Кушьян звучит нестандартно — основа Куш- не похожа на привычные армянские имена (например, Петросян, Аветисян).

Самая вероятная версия: основа восходит к армянскому слову «куш» (քուշ) — «птица», а точнее, к уменьшительной или прозвищной форме. В таком случае Кушьян — «сын птицы» или «потомок того, кого прозвали Птичкой». Прозвища по птицам давали за лёгкость, быстрый нрав, любовь к пению или, наоборот, за внешнее сходство (острый нос, маленький рост). В армянской ономастике это распространённый тип: ср. Арутюнян (от «арюц» — орёл), Цахканян (от «цветок»), но Кушьян встречается реже.

Менее вероятная, но допустимая гипотеза — связь с курдским или тюркским «куш» (например, в тюркских языках «куш» — тоже птица, но также «кош» — стоянка, становище). Армяне исторически жили в соседстве с тюркскими и курдскими народами, и заимствования в прозвищах случались. Однако суффикс -ян не оставляет сомнений, что фамилия оформилась именно в армянской среде, а не пришла извне.

Фамилия Кушьян не относится к числу массовых даже в армянском ареале. Она встречается в основном у армян, расселённых по России (Краснодарский край, Ростовская область, Москва) и в странах бывшего СССР. В исторических источниках XVIII–XIX веков — например, в исповедных ведомостях или ревизских сказках — Кушьян почти не попадается, что говорит о позднем оформлении или локальном бытовании.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: корень Куш- + суффикс -ян. Ударение, скорее всего, на последний слог — Кушья́н, как у большинства армянских фамилий. Варианты написания (Кушян, Кушан) встречаются, но редки и обычно результат описки или адаптации в русских документах.