Фамилия Кусочкина — это женская форма фамилии Кусочкин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или мирским именем Кусок. В русской ономастике это редкий случай, когда основа фамилии образована не от имени, профессии или внешности, а от абстрактного бытового понятия — «кусок» как часть целого.

Вероятнее всего, прозвище Кусок давали человеку невысокого роста, коренастому или, наоборот, тому, кто «откололся» от семьи — младшему сыну, который получил меньший надел или жил отдельно. В крестьянской среде слово «кусок» имело и уничижительный оттенок: «кусок» — это малая доля, недостаток, поэтому прозвище могло закрепиться за бедняком или тем, кого считали «неполноценным» в хозяйственном смысле. Есть и вторая версия, менее распространённая: в некоторых говорах «куском» называли скупого, жадного человека, который «каждый кусок считает».

Суффикс -ин в фамилии Кусочкин указывает на принадлежность: «чей?» — Кусочкин, то есть сын или потомок Кусочка. Уменьшительная форма Кусочка (а не просто Кусок) говорит о том, что прозвище было не грубым, а скорее бытовым, возможно, даже ласкательным — так могли называть ребёнка или молодого парня.

Фамилия Кусочкина встречается преимущественно в центральных и северных областях России, особенно в старых переписях Вологодской и Костромской губерний. Это не дворянская, а крестьянская или мещанская фамилия, что подтверждается отсутствием в родословных книгах. В отличие от однокоренных фамилий Кусков и Кусковский, которые могли возникать от топонимов (деревня Кусково), Кусочкин имеет исключительно прозвищное происхождение.