Фамилия Кустаева образована от имени Кустай, в основе которого лежит ингушское слово «куст» - «осанка, фигура, грация, внешность». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Кустаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.