Фамилия Куйшев — один из тех случаев, когда внешний облик слова может ввести в заблуждение. Она звучит на тюркский манер, но, скорее всего, перед нами чисто русская фамилия с редким диалектным корнем. Чтобы понять её происхождение, нужно смотреть не на начало, а на суффикс.

Основа фамилии — «Куйш». Если бы она была тюркской, мы бы ждали суффиксов -ов/-ев в значении «сын такого-то» (как в фамилиях Ахметов, Каримов), но в русском языке этот суффикс присоединяется к прозвищам и именам. Вероятнее всего, прозвище Куйш было дано человеку по действию. В русских говорах, особенно на юге и в Поволжье, слово «куй» — это форма повелительного наклонения от глагола «ковать» («куй железо»). Но прозвище «Куй» было бы слишком коротким и распространённым. Скорее, «Куйш» — это диалектный вариант имени или прозвища, образованный с помощью древнего суффикса -ш-, который в русской антропонимии часто давал ласкательные или уменьшительные формы (сравните: Павел → Павлуша → Павлуш, Иван → Иваш).

Есть вторая, более конкретная версия, которая связывает фамилию с ремеслом. В некоторых говорах «куйша» могли называть кузнеца или человека, занимающегося мелкой ковкой. Окончание -ев указывает на принадлежность: «Куйшев» — сын Куйша, то есть сын кузнеца или человека с таким прозвищем. Фамилия могла закрепиться в среде мастеровых людей, где прозвища по профессии давали часто и охотно.

Географически фамилия редкая, но её следы ведут в регионы, где было развито кустарное производство и где русские говоры соседствовали с тюркскими языками — например, в бывшую Симбирскую, Самарскую или Оренбургскую губернии. Там фамилии с основой «Куй-» встречаются чаще, чем в центральных областях.

Спорная гипотеза о тюркском корне «куй» (в значении «положи», «клади» или «лей») маловероятна: в тюркских языках такое слово редко становилось личным именем, а суффикс -ш там не образует отчества. Поэтому наиболее правдоподобной остаётся версия о русском диалектном прозвище, связанном с кузнечным делом. Предки Куйшевых, скорее всего, были не дворянами, а ремесленниками или крестьянами, получившими фамилию по прозвищу родоначальника.