Фамилия Кузовенина — женская форма фамилии Кузовенин, и её разбор стоит начать с необычного суффикса. Большинство русских фамилий на -ин образованы от основ на -а/-я (Петров — Петухов, но Плетнёв — Плетнин). Однако здесь мы видим -енин, что встречается реже и указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или на -ень. В данном случае корень «кузовен» скорее всего восходит к слову «кузов» — короб, плетёная корзина, а также кузов телеги или саней.

Вероятнее всего, прозвище Кузовень (или Кузовеня) получил мастер, делавший кузова, — корзинщик, плетельщик, или же человек, торговавший ими. В северных и центральных губерниях России, где был развит извоз, кузовом называли и верхнюю часть повозки, так что предок мог быть и тележным мастером. Суффикс -еня в прозвище типичен для северо-западных и новгородских говоров, где так образовывали уменьшительные или уничижительные формы: Кузовеня — «маленький кузов» или «сын Кузова».

Фамилия редкая, её географическая привязка — преимущественно Вологодская, Архангельская и Кировская области, что подтверждает связь с промыслами северной лесной зоны. Встречаются также варианты написания Кузовенин, Кузовенев (с суффиксом -ев, если основа на твёрдый согласный). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, носители — почти наверняка крестьяне или ремесленники.

Есть и менее вероятная версия — от канонического имени Козьма через форму Кузьма с последующей переделкой в Кузовеня (диалектное смягчение). Но её слабость в том, что от Кузьмы обычная фамилия Кузьмин, а Кузовенин — слишком далёкая трансформация, не подтверждённая источниками. Так что основная и самая правдоподобная гипотеза — профессиональное прозвище по ремеслу, связанному с плетением или изготовлением кузовов.