Фамилия Кузупеев — редкий пример, в котором почти каждый элемент заставляет задуматься. Начинать её разбор лучше не с корня, а с суффикса, потому что он выбивается из привычной русской схемы и сразу указывает на географию.

Типичная модель русской фамилии — это основа плюс суффикс принадлежности (-ов/-ев, -ин). Здесь же мы видим суффикс -еев. В русском языке это нестандартный вариант, который чаще встречается в фамилиях тюркского происхождения. Например, у татар, башкир или народов Кавказа суффикс -ев мог присоединяться к основам, оканчивающимся на гласный, или к именам, которые в русской передаче получили на конце «е». Это первая зацепка: фамилия, скорее всего, не великорусская, а пришла из тюркоязычной среды.

Корень Кузуп- — самая загадочная часть. Прямого и очевидного тюркского слова «кузуп» в современных языках нет. Здесь возможны две версии. Первая: основа восходит к тюркскому имени или прозвищу, которое в оригинале звучало как Кузеп или Кузуп. В некоторых тюркских диалектах «күз» — это «глаз», а «күзеп» может означать «зоркий», «смотрящий». Вторая версия, более правдоподобная: это искажённое при переносе в русскую речь имя Кузубай или Кузупей. Суффикс -бай (в русской записи часто превращается в -бей или -пей) был очень распространён у тюркских народов и означал «богатый», «хозяин». Имя Кузубай могло значить «богатый глазами» (в переносном смысле — проницательный, удачливый) или «глазастый хозяин». В русской среде «Кузубай» могло сократиться до «Кузуп» и получить окончание -еев.

Географически фамилия Кузупеев редкая и тяготеет к регионам с сильным тюркским влиянием: Оренбургская область, Башкортостан, Татарстан. Встречается она и у казахов. Это подтверждает версию о том, что предки носителя фамилии — не русские крестьяне, а, скорее всего, башкиры, татары или казахи, которые получили фамилию по отцу при оформлении документов в XIX веке. Сословие, скорее всего, было недворянским: тептяри, башкиры-вотчинники или государственные крестьяне из числа тюркского населения.

Таким образом, фамилия Кузупеев означает «сын Кузупа (Кузубая)». Человек, который её носит, почти наверняка имеет тюркские корни, а его предок носил прозвище, связанное либо с острым зрением, либо с богатством и состоятельностью.