Фамилия Кузуева образована от мужского прозвища или нецерковного имени Кузуй. В основе этого прозвища лежит, скорее всего, тюркское слово «кузу» — «ягненок» (ср. казахское «козы», турецкое «kuzu»). В русских говорах, особенно на юге и в Поволжье, где контакты с тюркскими народами были особенно тесны, такое прозвище могли дать человеку кроткого нрава, с мягкими кудрявыми волосами, либо, в ироничном ключе, — тому, кто «блеял», то есть говорил невнятно или гнусаво. Менее вероятна, но не исключена связь с диалектным глаголом «кузукать» (ворчать, брюзжать), однако тюркская этимология выглядит убедительнее из-за распространенности подобных «животных» прозвищ в среде служилых людей и крестьян XVI–XVII веков.

Фамилия построена по модели на -ев, что указывает на принадлежность: Кузуев — сын Кузуя. Форма с -ев, а не с -ов, объясняется мягким звучанием основы (Кузуй), что типично для русской адаптации тюркских имен. Поскольку фамилии на -ев в основном закреплялись за крестьянским и мещанским сословием, предки Кузуевых, вероятно, были государственными или помещичьими крестьянами, жившими в районах, где смешивались славянское и тюркское население — например, в бывшем Казанском ханстве, на территории современных Татарстана, Башкортостана, Оренбургской или Самарской областей.

В дореволюционных переписях фамилия встречается редко и преимущественно в юго-восточных губерниях. В советское время она зафиксирована в нескольких селах Ульяновской, Пензенской и Саратовской областей. Интересно, что в некоторых документах XIX века встречается вариант написания с одной «з» — «Кузуев» и «Кузуевъ», что указывает на неустойчивость орфографии в условиях низкой грамотности. В целом фамилия сохранила редкую для русской ономастики основу и сегодня встречается в основном в Поволжье и Зауралье, что подтверждает её локальное происхождение от конкретного прозвища, а не от широко распространённого церковного имени.