Фамилия Кысыкова — редкий случай, когда географический и языковой ключ лежит на поверхности, но при этом легко запутаться. Она явно несёт тюркский след, и её разбор стоит начать не с корня, а с ареала бытования. Основная масса носителей этой фамилии сосредоточена в Хакасии и на юге Красноярского края. Это прямой указатель на то, что перед нами фамилия, сформировавшаяся в среде, где тюркские языки были основными.

В центре фамилии — тюркское слово «кысык». В хакасском языке оно означает «узкий», «тесный», а также «залив», «протока» (узкое место реки). Прозвище Кысык могли дать человеку, жившему в узком ущелье, на берегу речной протоки, или же тому, кого характеризовали как замкнутого, «суженного» в поведении. Мужская форма Кысыков образована по стандартной русской модели патронимического суффикса -ов, что в XIX–XX веках было обычной практикой при оформлении фамилий для коренных народов Сибири.

Важно различать: фамилия Кысыкова — это женская форма, а мужская — Кысыков. В русской традиции фамилии на -ов/-ев склоняются по падежам: Кысыкова, Кысыковой, Кысыкову. Редкость фамилии в общероссийском масштабе — не недостаток, а преимущество для этимолога: здесь почти нет наслоений из других языков и регионов, и связь с исходным прозвищем прослеживается напрямую.

Вторая, менее вероятная версия, — связь с тюркским «кысык» в значении «наложница» или «любовница» (от глагола «кыс» — давить, притеснять). В этом случае прозвище могло быть неодобрительным, но в ономастике такие основы не редкость. Однако для Сибири, где фамилия встречается чаще, первое значение — географическое или характеризующее — выглядит убедительнее.

Таким образом, предки носительницы фамилии Кысыкова, скорее всего, были хакасами или представителями других тюркских народов Южной Сибири, жившими у узкого речного рукава или в теснине, и получили прозвище по месту жительства. Фамилия не имеет отношения к русским дворянским родам или славянским корням — её история целиком принадлежит сибирской земле.