Фамилия Кызьюров — редкая и территориально привязанная. Её основа — топоним, название реки Кызью (Кызъю) в Республике Коми. Гидроним переводится с коми языка как «девичья река» (кыз — «девушка», ю — «река»). Фамилию, скорее всего, получил человек, живший на этой реке или переселившийся оттуда. Модель образования типична для русского Севера и Приуралья: к основе на -ю добавили русский патронимический суффикс -ров (вариант -ов после мягкого согласного). Так возникла фамилия в значении «потомок того, кто с реки Кызью».

Суффикс -ров встречается реже, чем обычный -ов, и характерен для фамилий, образованных от географических названий на -й, -ь, -ю (сравните: Пермь — Пермяков, но если бы форма была «Пермьюров»). В случае с Кызьюровым суффикс «прирос» к основе, чтобы избежать неблагозвучного окончания «Кызьюв». Это типичный пример адаптации иноязычного топонима к русской словообразовательной модели.

Основная версия — топонимическая, и она самая правдоподобная. Альтернатива — происхождение от прозвища Кызьюр, но такое прозвище не зафиксировано в источниках, и его этимология неясна. Поэтому река остаётся главным источником фамилии. Фамилия бытует в основном в Республике Коми и соседних регионах, что подтверждает её локальное происхождение.

Носители фамилии — скорее всего, потомки крестьян или охотников-промысловиков из бассейна Вычегды или Печоры. Сословной элиты среди Кызьюровых не было: фамилия не встречается в родословных книгах дворянства. Это «географическая» фамилия, которая закрепилась за целой семьёй или несколькими семьями из одного места.