Фамилия Лапинус — редкий случай, когда русское по происхождению прозвище получило латинизированное окончание, характерное для семинарских фамилий. Если смотреть на корень, то основа «лапа» здесь очевидна: так могли прозвать человека с крупными руками или ногами, неуклюжего, либо того, кто работал руками — скажем, плотника или кузнеца. Но окончание -ус указывает на искусственное книжное происхождение: в XVIII–XIX веках семинаристы и духовные академики нередко переделывали русские фамилии на латинский манер, чтобы придать им «учёное» звучание. Лапин мог превратиться в Лапинус точно так же, как Смирнов — в Смирнус, а Соколов — в Соколус.

Вторая версия, менее вероятная, но упоминаемая в ономастической литературе, — связь с латинским словом lapis («камень»). Тогда Лапинус могло бы означать «каменный» или «подобный камню», но такое толкование натянуто: для прямого заимствования из латыни в русской среде нет убедительных примеров, а фамилия Lapinus в западноевропейских странах не встречается. Скорее всего, это именно искусственная форма от русского «Лапа».

Географически фамилия Лапинус почти не встречается за пределами бывшей Российской империи. В дореволюционных метрических книгах и исповедных ведомостях её носители — почти исключительно выходцы из духовного сословия: псаломщики, дьячки, священники. Это косвенно подтверждает семинарскую версию. В советское время фамилия стала большой редкостью — многие потомки либо сменили её на более привычную Лапин, либо уехали в эмиграцию.

Интересная деталь: среди однокоренных фамилий Лапин, Лапкин, Лаптев — Лапинус стоит особняком. Если первые три — типичные «бытовые» прозвищные фамилии, то Лапинус выбивается интеллигентским оттенком. Носитель такой фамилии в XIX веке почти наверняка был человеком грамотным, учившимся в духовном училище, и его фамилия — своего рода памятник той эпохе, когда церковные школы прививали вкус к классическим языкам даже в самых простых прозвищах.