Фамилия Леках — редкий случай, когда происхождение напрямую зависит от ударения и написания, которое не всегда очевидно. В русском языке эта фамилия чаще всего закреплена в форме с ударением на последний слог — Лека́х. Именно такое окончание (-ах) указывает на её принадлежность к северорусскому типу фамилий, распространённому в Архангельской, Вологодской и Вятской губерниях. Суффикс -их/-ых (в твёрдой форме -ах) означал принадлежность к роду: Лека́х — «из семьи Лека». Такие фамилии не склонялись и фиксировали целый род, а не отдельного человека.

Основа фамилии — прозвище или мирское имя Лек, Лека. В русских говорах «лека» — это знахарь, врачеватель, человек, умеющий «лечить» заговорами и травами. Прозвище могли дать деревенскому лекарю, костоправу или знахарю. В северных диалектах слово «лекать» означало «врачевать, заговаривать болезнь». Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был не просто крестьянином, а человеком с особым даром или ремеслом — умел «править» и заговаривать. Это выделяло его среди односельчан, и прозвище закрепилось за потомками.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с еврейскими фамилиями, образованными от ивритского корня «лех» (идти) или как вариант фамилии Левит. Однако в этом случае фамилия обычно писалась бы через «и» (Леках) и имела бы другое ударение. Для русской фамилии с окончанием -ах и основой «Лек-» версия с знахарем — основная и подтверждается северными говорами.

Интересно, что у фамилии Леках нет однокоренных вариантов вроде Лекаев или Леканов. Это говорит о её локальном бытовании: она не разошлась по стране вместе с переселенцами, а осталась в узком ареале. Встретить её сегодня можно в основном на Русском Севере и у потомков северных переселенцев в Сибири.