Фамилия Левоненкова — женская форма фамилии Левоненков, и её происхождение стоит разбирать через мужской вариант. В основе фамилии лежит имя или прозвище Левоненок. Суффикс -енок в русских и украинских фамилиях указывает на «молодого, малого» — сына или ученика. То есть Левоненок — это буквально «сын Левона» или «маленький Левон». Такая модель образования (имя + -енок → фамилия на -енков) типична для северных и центральных областей России, а также для Белоруссии, где суффикс -енок (и его варианты -онок, -ёнок) широко использовался в прозвищах и фамилиях.

Имя Левон — это народная, обиходная форма канонического имени Леонтий (от греческого «леон» — лев). В русской традиции имя Леонтий часто «обрусевало» в варианты Левон, Левонтий, а в южных и западных регионах — в Леон (отсюда и украинское Леоненко). Таким образом, Левоненков — это патронимическая фамилия, указывающая на предка по имени Левон.

Интересная деталь: в отличие от более распространённых фамилий на -ов/-ев, суффикс -енков встречается реже и часто выдаёт «низовое», крестьянское происхождение. Если в дворянских родах чаще использовали -ский или -ов без промежуточных суффиксов, то Левоненков — фамилия, типичная для крепостных крестьян или однодворцев (особенно в Курской, Орловской, Воронежской губерниях). Там фамилии с -енков образовывались от имён и прозвищ прямо в среде крестьянской общины, без участия приказных писарей.

Вероятно, первый носитель фамилии Левоненков был сыном крестьянина по имени Левон. Вариант написания через «а» (Левоненкова) — это уже женская форма, которая в русской традиции закрепилась за женщинами, но не меняет корневого значения. Встречается и вариант Левоненко (без -в) — это украинская параллель, где суффикс -енко выполняет ту же «сыновью» роль.

Географически фамилия Левоненкова (и Левоненков) чаще всего фиксируется в Брянской, Смоленской, Псковской областях и в восточной Беларуси — то есть в зоне, где пересекались русские и белорусские диалекты. Спорных версий происхождения у этой фамилии практически нет: она прозрачна по составу и однозначно восходит к имени Левон.