Фамилия Лифун — редкий случай, когда основа не даёт однозначного ответа, а заставляет выбирать между географией и прозвищем. Если отбросить самые натянутые версии, остаются две основные линии, и обе ведут в разные стороны.

Первая и самая вероятная — украинское или южнорусское происхождение от прозвища Лифун. В говорах юга России и Украины «лифун» — это тот, кто льёт, проливает (от глагола «лить»). Слово могло закрепиться за неаккуратным, раздражительным человеком, который «льёт через край» — то ли воду, то ли слова, то ли слёзы. Суффикс -ун в украинской и русской антропонимии активен: он образует прозвища по действию (бегун, крикун, ворчун). Фамилия Лифун могла закрепиться без дополнительного суффикса, что характерно для украинской модели (сравните: Кривун, Шептун). Такие фамилии нередко оставались без патронимического -ов, если носитель переселялся в великорусские губернии, но часто и оседали в форме на -ун.

Вторая версия — топонимическая. Есть село Лифуны в Харьковской области Украины (ныне Купянский район). Фамилия могла возникнуть как указание на выходца из этого села: «Лифун» — сокращение от «Лифуновский» или «Лифуненко», но в быту закрепилась форма по названию населённого пункта. В этом случае фамилия не имеет прямого отношения к прозвищу, а просто «привязана» к месту. Проверить это можно по старым ревизским сказкам: если большинство Лифунов в XIX веке жили именно в Харьковской губернии, версия с селом становится основной.

Словообразовательная модель проста: фамилия бессуффиксная, образована напрямую от прозвища или названия села. Суффикса -ов/-ев нет, поэтому фамилия склоняется как существительное мужского рода (Лифун, Лифуна, Лифуну). В женском варианте не изменяется.

Встречается фамилия и в записях как Лифунь — с мягким знаком на конце, что указывает на возможное белорусское или западноукраинское влияние, где -унь — уменьшительная форма. Но основной массив носителей — это юг России и восток Украины, что подтверждает связь с диалектным словом или селом.

Известных носителей с этой фамилией, которые бы вошли в энциклопедии или справочники, нет. Фамилия остаётся локальной, не разнесённой по стране массовыми переселениями. Это типичная «деревенская» фамилия, которая не прошла через канцелярскую унификацию XIX века и сохранила исходную форму — короткую, с прозрачным корнем, но с двумя разными путями возникновения.