Фамилия Лихоткин образована по распространённой модели от имени-прозвища Лихотка. В основе лежит диалектное слово «лихота», которое в старых говорах означало не только «злоба» или «недоброжелательство», но и «тоска», «горе». Казалось бы, значение невесёлое, но именно в этом и состоял смысл: имя Лихотка давали ребёнку как оберег. Славяне верили, что злые силы не позарятся на того, кого уже назвали «плохим» словом, — и мальчик вырастет счастливым, здоровым и весёлым, вопреки своему имени.

Суффикс -кин указывает на принадлежность: Лихоткин — «сын Лихотки». Это типичная русская фамилия, закрепившаяся в крестьянской среде. Встречается она преимущественно в центральных и поволжских регионах, но не является массовой или широко известной. В отличие от фамилий с корнем Лих- (Лихов, Лихин, Лиховцев), которые могли указывать на характер или ремесло, Лихоткин напрямую отсылает к старинному охранительному имени — и в этом её этнографическая ценность.