Фамилия Лимкина — женская форма фамилии Лимкин, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы на -к- и суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Лимкин буквально означает «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу Лимка. Вопрос лишь в том, что стояло за этим прозвищем.

Самая прямая версия — связь с растением. В русских говорах «лимка» — это не только уменьшительное от «лимона», но и местное название кислицы или щавеля. Прозвище Лимка могли дать человеку с кислым, недовольным выражением лица, либо тому, кто торговал лимонами или щавелем. В южных регионах, где лимоны были редкостью, такое прозвище могло закрепиться за приезжим торговцем или садоводом.

Менее очевидная, но исторически возможная версия — от тюркского имени Лим (или Лим-ка), которое встречалось у татар и башкир. В этом случае фамилия Лимкин — русифицированная форма матронима или отчества, где суффикс -ин добавили уже в русской среде. Следов такого имени в крестьянских переписях центральной России почти нет, но в Поволжье и Приуралье подобные случаи единично фиксировались.

Географически фамилия Лимкина не массовая. Чаще всего её носители встречаются в Воронежской, Ростовской областях и в Краснодарском крае — то есть в зоне исторического расселения чернозёмных крестьян и казачества. Это косвенно подтверждает бытовую, прозвищную природу фамилии: в среде земледельцев и торговцев прозвища по растениям или товару были обычным делом. Сословно — скорее всего, однодворцы или государственные крестьяне, так как дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не значится.

Написание «Лимкина» с буквой «и» в первом слоге устойчиво, хотя в диалектах могло произноситься и как «Лёмкина». Вариант с «ё» встречается, но редко — это следствие местного аканья или оканья, не повлиявшего на письменную фиксацию.