Фамилия Лимончиков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Лимончиков послужило церковное имя Филимон. Маловероятно, что в основе фамилии Лимончиков лежит название цитрусового «лимон», поскольку в старой России этот фрукт известен немногим. Недаром даже бытовала присказка: «Не наша еда лимоны, есть их иному». Однако еще в 1490 году на Белом озере был зарегистрирован крестьянин Гридя Лимонов. На самом деле фамилия Лимончиков восходит к каноническому мужскому имени Филимон, которое в переводе с греческого означает «любимый». В основу же фамилии легла усеченная форма этого имени — Лимон, Лимончик. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лимончик, со временем получил фамилию Лимончиков. О точном месте и времени возникновения фамилии Лимончиков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Лимончиков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.