Фамилия Лимонников, вероятнее всего, образована от имени Лимонник. Оно является производной формой имени Филимон, которое в переводе с греческого означает «любимый». Одним из покровителей этого имени считается святой мученик Филимон. Он в числе других девяти мучеников обличал язычников и проповедовал веру Христову, за что был подвержен мучениям. Таким образом, потомок человека, которого звали Лимонник, со временем получил фамилию Лимонников. Так, в Книге памяти Республики Мордовия упоминается Алексей Федорович Лимонников, родившийся в 1902 году селе Арх.-Галицино Рузаевского района. В документах Архангельской области можно найти сведения об Иване Ильиче Лимонникове, родившемся в 1888 году в деревне Елкино Мезенского района, Иване Марковиче Лимонникове, родившемся в 1909 году там же.