Основой фамилии Линушкин послужило церковное имя Лин. Фамилия Линушкин ведет свое начало от старинного мужского имени Лин, которое образовано от греческого «линос», что означает «скорбная песнь». В основу же данной фамилии легла его уменьшительно-ласкательная форма - Линушка. Вероятно, основатель рода Линушкиных был выходцем из высшего сословия. Согласно другой версии, фамилия Линушкина происходит от прозвища Линушка, в основу которого легло украинское слово "линка", то есть "лодырь". Таким образом, потомок человека, обладающего именем Линушка, со временем получил фамилию Линушкин.