Фамилия Липсток — редкий случай, когда происхождение почти наверняка ведёт в литовскую языковую среду, а не в славянскую. В основе лежит литовский глагол lipti — «лезть, влезать, взбираться, восходить». От него образовалось прозвище, которое затем закрепилось как фамилия.

Что означало такое прозвище? Скорее всего, оно характеризовало поведение человека. «Лезть» в переносном смысле — проявлять настойчивость, упорство в достижении цели, а иногда и излишнее любопытство, склонность вмешиваться в чужие разговоры и дела. В старых литовских говорах такое прозвище мог получить и тот, кто постоянно карабкался по деревьям или скалам, и тот, кто «лез» в спор или ссору.

Суффикс -ок в фамилии Липсток — не русский уменьшительный, а скорее характерный для литовских и белорусских фамилий формант, который мог оформлять прозвище в фамилию. В литовской ономастике есть целый ряд фамилий на -okas, и при переходе в русскую среду окончание часто адаптировалось как -ок. Таким образом, Липсток — это русифицированная форма исходной литовской фамилии.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи: Литве, Белоруссии, а также к пограничным районам Польши. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальное, возможно, даже диалектное происхождение. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые массово давались крестьянам после отмены крепостного права, Липсток могла сформироваться раньше, в среде литовского или белорусского шляхетства или мещанства, где была распространена модель фамилий на -ок.

Других версий происхождения, например от немецкого Lippstock (губная палочка) или английского lipstock (что-то связанное с губами), нет — они надуманы и не подтверждаются ни историческими источниками, ни географией фамилии. Единственная рабочая гипотеза — литовский глагол lipti и его прозвищное значение.