Основой фамилии Лисишин послужило мирское имя Лисиша. Скорее всего, Лисиша — уменьшительно-ласкательный вариант имени Лисица. Давая младенцу такое имя, как, например, Лисица, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Не исключено и то, в основу фамилии легло прозвище Лисиша, которое получил плут, хитрец. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Лисиша, со временем получил фамилию Лисишин.