Фамилия Лиссабонов — редкий случай в русском ономастиконе, когда в основе фамилии лежит не местное прозвище или имя, а западноевропейский топоним. Она образована от прозвища Лиссабон, которое давали человеку, имевшему отношение к столице Португалии. Чаще всего так называли выходца из этого города либо того, кто долго там прожил или торговал с португальскими землями.

Название города Лиссабон — одно из древнейших в Европе. По мнению исследователей, ещё около 1200 года до нашей эры на месте современного центра города мог существовать финикийский торговый порт. Само название, скорее всего, дороманского происхождения: его возводят к древнему именованию реки Тежу — Lisso или Lucio. В русской традиции топоним закрепился через европейские языки, и прозвище Лиссабон могло появиться у купцов, моряков или дипломатов, посещавших Португалию.

Суффикс -ов в фамилии Лиссабонов — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность: «сын Лиссабона». Такая модель характерна для фамилий, возникших в среде служилых людей и купечества, где прозвища по географическим названиям были распространены. В отличие от фамилий на -ский (типа Лиссабонский), которые чаще носили дворяне или духовенство, форма на -ов говорит о более демократичном, возможно, посадском или крестьянском происхождении.

Интересно, что в Лиссабоне издавна существует иудейская община, насчитывающая сегодня чуть более тысячи прихожан. Поэтому не исключено, что предок носителя фамилии Лиссабонов мог быть связан с этой общиной — например, быть сефардским евреем, переселившимся в Российскую империю. Однако прямыми документальными подтверждениями эта версия не подкреплена, и основным остаётся объяснение через топонимическое прозвище.

Фамилия Лиссабонов нечастотна. Она почти не встречается в старых боярских или дворянских списках, что косвенно подтверждает её позднее происхождение — скорее всего, XVIII–XIX века, когда в России активизировались внешнеторговые связи. Носители фамилии могли быть мещанами или купцами, имевшими дело с заморскими товарами.