Фамилия Лисаконов образована от прозвища Лисакон, которое, вероятно, восходит к украинскому слову «лiсак» со значением «лысый». Вполне вероятно,это прозвище указывало на особенности внешности предка. Однако так могли называть опытного, бывалого человека. Не исключено также, что в основе фамилии Лисаконов лежит топоним Лисаковск — это город в Костанайской области Казахстана. Расположен он на правом берегу реки Тобол (приток Иртыша). В таком случае, предок человека по фамилии Лисаконов мог быть выходцем из этого города. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лисакон, со временем получил фамилию Лисаконов.