Прозвище Лисакон, вероятно, восходит к украинскому слову «лiсак» со значением «лысый». Вероятнее всего, основатель рода Лисаконовых получил такое прозвище за свои внешние особенности. Однако так могли называть опытного, бывалого человека. Не исключено также, что в основе фамилии Лисаконова лежит топоним Лисаковск — это город в Костанайской области Казахстана. Расположен он на правом берегу реки Тобол (приток Иртыша). В таком случае, предок человека по фамилии Лисаконова мог быть выходцем из этого города. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лисакон, со временем получил фамилию Лисаконова.