Фамилия Лобканов звучит на редкость прозрачно, но эта прозрачность обманчива. В основе лежит слово «лобок» — так в русских говорах называли не только анатомическую область, но и небольшой лоб, а также низкий, пологий холм или пригорок. Однако прямое, «телесное» значение вряд ли было основой для прозвища: в крестьянской среде подобные наименования давали по внешности, и «Лобок» — человек с выпуклым, широким или, наоборот, маленьким лбом. Второй вариант — прозвище по месту жительства: «живущий на лобке», то есть на возвышенности, на бугре. В псковских и новгородских говорах «лобок» также означал часть печи или уступ в русле реки, но эти значения встречались реже.

Суффикс -ан- (-ан) в фамилиях обычно указывает на принадлежность или характерный признак: Лобкан — это «лобкастый», человек с приметным лбом. Форма Лобканов — притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?»: сын Лобкана. Модель образования типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ов и -ев вытеснили более древние формы на -ин. Встречается фамилия преимущественно в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает версию о прозвище по рельефу: переселенцы часто получали фамилии по приметам местности на новом месте.

Любопытно, что однокоренная фамилия Лобков распространена шире, а Лобканов — более редкий вариант. В дореволюционных переписях носители этой фамилии записаны как государственные крестьяне, реже — мещане. Сословной элиты среди Лобканов не было, что типично для «говорящих» фамилий, образованных от прозвищ: они закрепились в низших слоях, где человека называли по самому заметному внешнему или бытовому признаку.