Фамилия Лобзеев образована от прозвища или нецерковного имени Лобзей по стандартной модели с суффиксом -ев. Основа — слово «лоб», но не в прямом анатомическом значении. В русских говорах «лобзёй» называли человека с большим или выпуклым лбом, а также упрямого, «лобастого» — того, кто «прёт лбом». Встречается и глагольная версия: от диалектного «лобзать» (целовать), но она менее вероятна для прозвища, так как обычно отглагольные фамилии образуются от форм прошедшего времени (Лобзал, Лобзаев). Прозвище Лобзей — типичное для северных и центральных областей России, где активно использовались «лобовые» прозвища (Лобан, Лобанов, Лобачёв).

Модель с суффиксом -ей в основе (Лобзей → Лобзеев) встречается реже, чем -ан или -ач. Это указывает на то, что прозвище могло быть образовано с уменьшительно-пренебрежительным оттенком: Лобзей — не просто «лоб», а «лобок», «лбишко». В ономастике этот суффикс фиксируется в севернорусских фамилиях, например, Козей → Козеев, Гузей → Гузеев. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, был выходцем из новгородских или вятских земель, где такие словообразовательные формы были в ходу.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда её связывают с тюркским «лобза» (высокий, видный), но это натяжка: корень «лоб» в русском языке даёт более прозрачную и естественную этимологию, и фамилия не имеет признаков заимствования (нет характерных тюркских суффиксов). Социально Лобзеевы могли быть крестьянами или посадскими людьми — фамилия не дворянская, не княжеская, а типичная «прозвищная», то есть закрепилась за родом в XVI–XVII веках, когда крестьян начали массово переписывать.

В документах фамилия встречается с конца XVIII века, преимущественно в Вятской и Пермской губерниях. В современной России Лобзеевы живут рассеянно, без выраженного регионального гнезда, что говорит о постепенном расселении рода. Написание с двумя «е» (Лобзеев, а не Лобзев) — результат того, что основа на -ей: Лобзей + ев = Лобзеев, где гласная «е» сохраняется.