Фамилия Лодышкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не изменилось за столетия. Перед нами типичная «сыновья» фамилия на -ин, образованная от личного прозвища Лодышка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Лодышкин, то есть сын Лодышки.

Само слово «лодышка» в русских говорах имело два значения. Первое — анатомическое: щиколотка, косточка на ноге, выступающая в голеностопе. Второе — переносное, прозвищное: так могли назвать человека маленького роста, щуплого или, напротив, того, кто при ходьбе заметно косолапил, «шаркал лодышками». В ряде южнорусских диалектов «лодыжка» означала ещё и неловкого, неуклюжего человека. Таким образом, Лодышкин — потомок человека, получившего уличное имя по внешнему признаку или походке.

Важно не путать эту фамилию с гораздо более известной фамилией Лодыгин. В основе Лодыгина лежит слово «лодыга» — кость для игры в бабки, и прозвище относилось к игроку. Лодышкин же происходит от уменьшительной формы «лодышка» — более конкретного и бытового прозвища, что редкость: обычно фамилии образуются от полной формы (Лодыгин), а уменьшительная остаётся в тени.

С точки зрения географии, фамилия Лодышкин встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда. Её можно встретить и в центральных областях России, и в Поволжье, причём носители не образуют сплошного массива. Это говорит о том, что прозвище возникало в разных местах независимо — как описательное имя для конкретного человека, а не как наследственное родовое имя целой волости.

Сословная принадлежность предков Лодышкиных, скорее всего, была крестьянской или мещанской. Фамилии на -ин, образованные от нарицательных прозвищ, в массе своей закрепились за непривилегированными слоями населения в XVII–XIX веках. Дворянские фамилии того же типа обычно имеют книжную или географическую основу, а «Лодышкин» — чисто бытовое, деревенское прозвище, которое не стало фамилией аристократии.