Фамилия Логис — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет типичного русского суффикса -ов, -ев или -ин, что сразу наводит на мысль: перед нами либо фамилия, застывшая в начальной форме (как, например, у украинских, белорусских или польских фамилий на -ис, -ыс), либо вариант, возникший из иноязычного корня.

Самая вероятная версия — что Логис это сокращённая или адаптированная форма от крестильного имени Логгин (Лонгин). В просторечии имя Лонгин нередко звучало как Логвин, а в некоторых диалектах и при польском влиянии (где -и- в окончании встречается часто) могло превратиться в Логис. Суффикс -ис в данном случае не уменьшительный, а скорее указывает на принадлежность к роду: «сын Логгина» или «человек из семьи Логиса». Такая модель встречается в западных регионах бывшей Речи Посполитой — на территории современной Беларуси, Литвы и восточной Польши.

Вторая, менее распространённая гипотеза, связывает фамилию с литовским корнем. В литовском языке слово «logis» означает «логичный», но как прозвище оно маловероятно — слишком книжное для бытовой ономастики. Скорее, это могла быть фамилия от личного имени Логис (как вариант Логина), либо топонимическая — от названия хутора или усадьбы с похожим корнем.

Географически фамилия Логис встречается в основном в Литве и на приграничных территориях Беларуси, а также в среде потомков литовских татар. В русских документах XIX века носители фамилии фиксировались в Ковенской и Виленской губерниях. Сословно это были преимущественно крестьяне и мещане, реже — однодворцы.

Поскольку фамилия не имеет ярко выраженного «ремесленного» или «прозвищного» значения, её основное содержание — указание на родство с человеком по имени Логгин (Лонгин). В переводе с латыни «Longinus» означает «длинный», но в бытовом употреблении это имя потеряло связь с первоначальным смыслом и стало просто семейным знаком.