Фамилия Логонцев — редкий случай, когда при одинаковом звучании возможны два совершенно разных объяснения, и оба имеют право на существование. Чтобы разобраться, нужно посмотреть на суффикс и на то, как могла выглядеть основа.

Суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — Логонцев, то есть сын Логонца). Сама основа Логонец в русском языке напрямую не встречается, но она могла появиться двумя путями. Первый — от прозвища или профессии. В южнорусских и украинских говорах словом «логон» или «лагун» называли бочонок, кадку для воды или дёгтя. Человека, который делал такие бочонки или торговал ими, могли прозвать Логонцем. По этой модели образованы фамилии Бочкарёв, Кадашников, Дёгтев — все от названий ёмкостей и ремесленных терминов.

Вторая версия — географическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Логоново, Логонка или Логонец. Такие топонимы встречаются в центральной России, хотя и не слишком широко. В этом случае Логонцев — это «выходец из Логонца» или «житель деревни Логоново». Суффикс -ец в основе (Логон-ец) как раз характерен для обозначения жителя по месту: скажем, елец — из Ельца, тверец — из Твери. Если это так, то фамилия — типичный пример «географического» прозвища, которое закрепилось за переселенцем.

Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит крестильное имя. В святцах нет имени Логон, но в народной традиции могли переделать редкое каноническое имя (например, Логгин) в более привычную форму Логон, откуда и пошёл Логонец. Однако для такой гипотезы нет надёжных подтверждений.

В написании фамилии важно не путать её с похожими: Логонцов (с суффиксом -ов) и Логонцев — это разные модели. Форма на -ев чаще встречается у фамилий, образованных от слов на -ец или от названий, оканчивающихся на мягкий согласный. Поэтому, если ваш предок был Логонец (бочар или житель Логонца), его сын записывался именно как Логонцев.

Географически фамилия тяготеет к югу России и бывшим южным губерниям — Курской, Воронежской, Тамбовской. Там и бондарное ремесло было развито, и говоры с «лагун» распространены. Если у вас есть сведения о том, откуда родом ваши Логонцевы, это может помочь выбрать между «ремесленной» и «географической» версией.