Фамилия Лонеш — редкая и неочевидная для русского уха. Если смотреть на её окончание, первое, что приходит в голову: это не типичная русская фамилия на -ов, -ин или -ский. Суффикс -еш указывает на иноязычное происхождение, скорее всего, из западных или южных славянских языков, либо из балтийской или германской среды.

Вероятнее всего, основа Лон- восходит к прозвищу или личному имени. В польском, чешском и словацком языках есть слово «łoń» (устар. «олень») или «łania» (лань). Фамилия могла образоваться от прозвища Лонеш — «оленеподобный», то есть быстрый, стройный или пугливый человек. В таком случае суффикс -еш — это уменьшительная или прозвищная форма, характерная для чешской и словацкой ономастики (сравните: Лонек, Лонеш — как Янек, Янеш от Ян).

Другая версия — немецкое или еврейское происхождение. Фамилия могла возникнуть от немецкого «Lohn» (плата, вознаграждение) или «Löwe» (лев), но в форме Lonesch — это скорее искажённая передача при переселении в восточноевропейские земли. В польских и украинских метриках встречаются написания Łoniesz, Łonesz, что может быть вариантом фамилии Лонский или Лоневский, усечённым на слух.

Географически фамилия Лонеш чаще всего фиксируется в западных областях Украины (Львовская, Волынская области) и в Польше (Подкарпатье, Малопольша). В России она встречается единично, как след миграции конца XIX — начала XX века. Сословно носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, реже — ремесленниками.

С точки зрения словообразования, это типичная «прозвищная» модель без патронимического суффикса. Фамилия застыла в той форме, в какой прозвище дали первому носителю. Если сравнивать с однокоренными, то параллели — Лонский, Лоневский, Лончак — все они отсылают к той же основе «лонь» в значении «олень» или к топониму Лонь (название села в Польше). Лонеш, в отличие от них, сохранила более архаичный и редкий суффикс, что делает её ценной для историков языка.