Фамилия Лонеев — редкий случай, когда основа настолько тёмная, что угадать её с ходу не получится. В ней нет привычных «медведевских» или «кузнецовских» корней, и это делает разбор особенно интересным.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Лонеев — потомок человека по прозвищу или имени Лоней. А вот откуда взялось само слово «Лоней» — главный вопрос.

Напрашивается связь с диалектным словом «лонь» или «лоня», которое в некоторых говорах (особенно северных и сибирских) означало «прошлый год», «прошлогодний». Отсюда «лоня» — прозвище для человека, который родился в прошлом году? Звучит странно, но в русской ономастике такие «календарные» прозвища встречаются: «Позапрошлогодний», «Третьяк» (третий ребёнок), «Шестак». Однако «лоня» могло означать и нечто другое: в архангельских говорах «лоня» — это «лентяй», «бездельник». Если так, то Лоней прозвали человека медлительного или ленивого, а его дети стали Лонеевыми.

Есть и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть из искажённого крестильного имени. Например, от канонического имени Леонтий (в народе — Левонтий, Лёня) через форму «Лоня» (с заменой «ё» на «о» под влиянием акающих говоров). Или от имени Лонгин (редкое, но известное в святцах). В таком случае Лонеев — это вариант фамилии Лонгинов или Лёнин, но с местным фонетическим изменением.

География фамилии тоже показательна. Лонеевы встречаются в основном в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Башкортостане. Это регионы, где активно шло заселение в XVII–XVIII веках, и где фамилии часто «застывали» в той форме, в какой их записал писарь со слов крестьянина. Поэтому нельзя исключать, что первоначальное прозвище звучало как «Лоняй» (от глагола «лонять» — шататься, бродить без дела), а в документах превратилось в «Лоней» — и пошло по цепочке.

Однозначного ответа, кем были предки Лонеевых, нет. Скорее всего, это крестьянская фамилия, образованная от прозвища, которое дали по характеру, поведению или обстоятельствам рождения. Версия с «прошлогодним» ребёнком выглядит натянутой, версия с ленью — правдоподобнее, а вариант с искажением крестильного имени — самый простой и потому наиболее вероятный.