Фамилия Лошкарев (и её вариант Лошкарёв) образована от прозвища Лошкарь. Основа здесь — слово «ложка», а суффикс -арь указывает на род занятий. Лошкарь — это мастер, который делал ложки. В старину такое прозвище давали ремесленникам по дереву: ложки были ходовым товаром, и резчиков по дереву ценили. Чередование «ж» на «ш» в корне — не ошибка, а естественный фонетический процесс: звонкий «ж» перед глухим «к» оглушается, отсюда и «Лошкарь» вместо «Ложкарь». Со временем прозвище закрепилось как фамильное имя, и потомки мастера стали Лошкаревыми.

Интересно, что эта фамилия — не единственная в ряду «ложечных». Есть и однокоренные Ложкарев, Ложкин, но Лошкарев отличается именно своей диалектной или просторечной огласовкой. Словарь русских фамилий Б. Унбегауна относит такие формы к типичным для северных и центральных говоров, где оглушение согласных было устойчивой нормой. Так что предки Лошкаревых, скорее всего, жили в тех краях, где «лóшка» звучало естественнее, чем «лóжка».

Вариант с ударением на последний слог — Лошкарёв — более поздний, возникший под влиянием орфографической нормы: буква «ё» в фамилиях часто указывает на ударный гласный, хотя по происхождению это та же самая фамилия. Встречаются оба написания, но суть одна: за фамилией стоит конкретное ремесло, а не прозвище по внешности или характеру.