Фамилия Лоскутина ведет начало от прозвища Лоскута. В его основе — нарицательное «лоскут», то есть отрезок ткани или кожи. Поэтому предок обладательницы этой фамилии мог заниматься портняжным делом или торговать тканями. Прозвища и фамилии с этим корнем были в старину довольно популярны: историк С. Б. Веселовский упоминает шуйского крестьянина Ивана Лоскута (1579 год), рязанского пушкаря Лоскута (1638 год) и Ивана Алексеевича Лоскутова (1596 год). Прозвище Лоскута закрепилось за человеком как основное именование, а со временем легло в основу фамилии Лоскутина.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Лоскутин, то есть сын или потомок Лоскуты. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имен, оканчивающихся на -а. Географически фамилия встречается в разных регионах, но чаще всего ее носители связаны с северными и центральными областями России, где портновское ремесло и торговля тканями были распространены повсеместно.