Фамилия Лупето — редкий случай, когда географическая привязка почти полностью снимает вопросы о происхождении. С высокой вероятностью это украинская или южнорусская фамилия, образованная от прозвища или имени с помощью суффикса -ет(о). Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Лупетó.

Основа «Луп-» восходит к глаголу «лупить» — в старых говорах он означал не только «бить», но и «чистить (кору, кожуру)», «обдирать», а также «жадно есть» или «выпивать». Прозвище Лупето могли дать человеку с крутым нравом, драчуну, либо, наоборот, тому, кто занимался обдиркой коры для лыка или выделкой кож. В украинском языке «луп» — это ещё и очистки, шелуха, так что прозвище могло закрепиться за неряшливым или неаккуратным человеком. Вторая версия, менее вероятная, — что в основе лежит дохристианское имя Луп, редкое, но фиксируемое в древнерусских памятниках (от «лупить» в значении «сильный, бьющий»).

Суффикс -ет(о) характерен для украинской и белорусской антропонимии. Он не столько уменьшительный, сколько прозвищный, часто придаёт фамилии оттенок принадлежности: Лупето — «тот, кто сын или потомок Лупа». В русских фамилиях такой формант встречается реже, чаще в южных регионах, граничащих с Украиной (Курская, Воронежская области, Кубань). В польском языке похожий суффикс -eta давал фамилии от имён на -л, но для фамилии Лупето это скорее исключение.

Фамилия недворянская, не встречается в старых боярских списках или Родословных книгах. Она бытовала в среде крестьян и казаков. В реестрах Войска Запорожского могли встречаться люди с прозвищем Луп, но документальных подтверждений фамилии Лупето в XVII веке нет — она фиксируется в основном с XIX века, в метрических книгах Черниговской, Полтавской и Харьковской губерний. Сегодня фамилия остаётся малочисленной, но стабильно встречается на юге России, в восточной Украине и среди потомков переселенцев в Сибири.

Однокоренные фамилии — Лупенко, Лупанов, Лупин — показывают, что корень «луп-» был продуктивным в народной ономастике. Лупето стоит в этом ряду особняком именно из-за редкого суффикса, который не даёт спутать её с русскими фамилиями на -ов и сразу указывает на юго-западное происхождение предков.