Фамилия Лужкова — женская форма мужской фамилии Лужков. Её происхождение связано не с городом, а с природным объектом: лугом, точнее — с лужком, то есть небольшим лугом или лужайкой. В основе фамилии лежит прозвище Лужок, которое давали человеку, жившему у такого места, либо владевшему им. Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -ок (Лужок) плюс притяжательный суффикс -ов, означающий «сын Лужка» или «из семьи Лужка».

Интересно, что фамилия Лужков — не самая ходовая для центра России. Она встречается чаще в южных и западных регионах, где луговая лексика была особенно актуальна в хозяйственном укладе. В говорах слово «лужок» могло означать не просто луг, а заливной участок у реки, что делает прозвище ещё более конкретным: предок мог пасти скот на таком участке или косить там сено.

Мужская форма Лужков известна с XVI–XVII веков, упоминается в актах по Рязанскому и Тульскому краям. В дворянских родословных эта фамилия не фиксируется — она оставалась крестьянской и мещанской, что естественно для названия по земельному угодью. В XX веке фамилия получила широкую известность благодаря мэру Москвы, но её корни уходят в простую сельскую топонимику.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Лужков стоит в ряду Лужкин (от женского прозвища Лужка), Луговой (от прилагательного) и Луговский (с фамильным суффиксом -ский). Разница в том, что Лужков — самая прямая и древняя форма: она не переосмыслялась, а просто закрепила за человеком его связь с конкретным местом.