Фамилия Лужникова образована от прозвища Лужник. В его основе лежит прилагательное «лужный» — то есть «относящийся к лугу». Лужником в старину называли человека, жившего на лугу или владевшего им. Луга играли важную роль в хозяйстве: именно там заготавливали сено на зиму, поэтому такое прозвище могло закрепиться за крестьянином, чья жизнь была тесно связана с луговыми угодьями.

Модель образования фамилии проста: суффикс -ов- (в женском роде -ова) присоединился к прозвищу Лужник. По такой же схеме возникли фамилии Луговой, Луговский, Луговкин. В словаре С. Б. Веселовского встречаются родственные именования: нижегородский крестьянин Луговой Иван Семенов (1608 год) и новгородец Луговской Томило Иудич Нежданов (1602 год). Эти примеры показывают, что прозвища от слова «луг» были распространены в разных регионах.

Прозвище Лужник, скорее всего, закрепилось за конкретным человеком как его основное бытовое имя, а затем перешло к детям и внукам уже в форме фамилии. Так потомок человека по прозвищу Лужник со временем стал носителем фамилии Лужникова.